MySQL引入了服务器端实用程序，可让我们管理远程计算机上的多个实例。
我正在为早期版本的mysql寻找类似的功能。

[1] http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/instance-manager.html

解决方案

我对实例管理器不熟悉，但是我已经在多个系统(包括远程托管服务器)上使用phpMyAdmin取得了很大的成功。它支持MySQL 5.0和4.1.